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27 mars 2023

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par Science China Press

Récemment, l'équipe de recherche dirigée par le Dr Shunping He de l'Institut des sciences et de l'ingénierie des fonds marins de l'Académie chinoise des sciences a publié les résultats de ses recherches dans la version en ligne de Science China Life Sciences.

Ils ont rapporté le premier génome de haute qualité d'une anguille des grands fonds (Ilyophis brunneus), qui met en lumière les mécanismes moléculaires de l'adaptation en haute mer. L'échantillon d'anguille de haute mer a été obtenu par le submersible habité chinois "Shen Hai Yong Shi", à une profondeur de 3 500 mètres dans la fosse des Mariannes. Les chercheurs ont identifié l'anguille comme une anguille à dents de flèche boueuse (MAE) grâce à l'observation morphologique et à l'analyse des codes-barres mitochondriaux.

Pour étudier les mécanismes moléculaires de l'adaptation en haute mer chez l'anguille, les chercheurs ont d'abord séquencé et assemblé un génome de haute qualité du MAE à l'aide des technologies de séquençage à haut débit Illumina, PacBio et Hi-C. Ils ont ensuite mené des analyses phylogénétiques et génomiques comparatives pour élucider son origine et ses mécanismes d'adaptation.

L'étude a révélé que plusieurs gènes critiques liés au maintien et à la régulation du cytosquelette avaient subi des mutations spécifiques, tels que les gènes TUGBCP3 et ITGA, qui ont subi une forte sélection positive. TUBGCP3 est un composant essentiel du complexe γ-tubuline et joue un rôle crucial dans la nucléation des microtubules dans le centrosome, tandis que l'ITGA favorise la stabilité du cytosquelette des microtubules et régule l'assemblage du cytosquelette.

Les chercheurs ont également découvert qu'un grand nombre de familles de gènes subissaient une expansion, une sélection positive et une évolution rapide, qui étaient liées à la capacité de réparation de l'ADN, à la fluidité de la membrane, aux processus normaux de transcription et de traduction et au métabolisme énergétique.

De plus, l'analyse de la pression de sélection des anguilles d'eau profonde, des anguilles européennes et d'autres espèces de poissons d'eau peu profonde a révélé que la valeur ω des anguilles d'eau profonde était significativement plus élevée que celle des autres espèces de poissons, ce qui suggère que l'anguille d'eau profonde a probablement connu une évolution fonctionnelle accélérée dans l'environnement extrême des eaux profondes. Ces variations génétiques ont peut-être permis à l'anguille des grands fonds d'évoluer dans sa capacité à s'adapter à des environnements profonds extrêmes.

Plus d'information: Jie Chen et al, L'assemblage du génome de longueur pseudo-chromosome pour une anguille de haute mer Ilyophis brunneus met en lumière l'adaptation en haute mer, Science China Life Sciences (2023). DOI : 10.1007/s11427-022-2251-8

Informations sur la revue :Science Sciences de la vie en Chine

Fourni par Science China Press